楠木邸的神明庭院

楠木湊從小就能看見一般人看不見的東西，他在因緣際會下受託管理一處位於鄉間的新蓋透天厝，在那座庭院裡，隔壁的山神突然現身，甚至連現代陰陽師播磨才賀也找上了湊……。

湊為了供奉山神及其眷屬，世里、拓莉卡和烏梓祭，一直買高級點心給牠們吃，導致自己陷入缺錢的窘境，但是某天，他的財運突然變超好，原來這一切都是託靈龜的力量所賜，靈龜是一種靈獸，據說能帶來各種吉利。

陰陽師一條盯上湊所畫的護符，造訪楠木邸，但他卻被山神的力量送到神域。另一方面，湊得到風神賜予的風之力，決定開始修行以提升這股力量……。

春天到來，陰陽師播磨等人正為了頻繁出現的惡靈感到苦惱。另一方面，各地也接連出現被神明放棄的廢棄神域入口。湊被拖進其中一個神域，並在那裡遇見神祕的女神。

湊得到女神給的封印之力，為了駕馭那股力量開始反覆進行嘗試，但是卻不怎麼順利。此時，湊在山神的建議下前往山裡挖竹筍，沒想到那裡竟然出現野生的熊……！

湊因為無法靈活掌控封印之力而苦惱，讓他回想起小時候，他從小就能看見常人看不見的事物。老家的溫泉旅館裡，住著形形色色的妖怪。某天，一位戴著巴拿馬帽的神祕男子，造訪了那間旅館。

夏天到了，山神將楠木邸的庭院改造成夏季風格。湊與山神一起去買東西，回程的路上，在位於方丈山隔壁山上的稻荷神社前，被一股看不見的力量吸引。那裡的神明天狐好像和山神有什麼因緣……。

湊認為山神敗給天狐而情緒低落，為了讓山神振作起來，便帶著祂一起出門逛街。他們造訪了刊登甜點資訊的城鎮雜誌出版社，以及咖哩店等地，但此時楠木邸正面臨危機。

播磨來拜訪湊，說最近鎮上不知為何出現大量惡靈，山神也感受到不尋常的氣息。就在此時，神話中的神明須佐之男出現在楠木家的庭院，還說要訓練湊……。

明天是三年一次的方丈祭，湊和山神在商店街玩陀螺的同時，播磨等陰陽師正把兩名惡劣的驅魔師逼入絕境，就在這一刻，上空突然出現神祕的巨大廢棄神域，並釋出無數惡靈！

山神用僅存的力量，成功消滅巨大廢棄神域的入口，但身為一切元凶的巨大惡靈卻現身了。湊能否運用驅邪之力和風之力，順利解決這隻惡靈呢……？