「格蘭希學院」，人稱＂偉大種子＂的這所學院，正是負責培育少年少女們，使英雄寄宿其身來戰鬥、對抗破壞軍的搖籃。在七騎士成員的法里亞的引導下，尼莫來到格蘭希學院，遇見憎恨「弗西斯」的少年劍士喬・鶴木。喬相當反彈法里亞安排加入尼莫七騎士的決定。在遇見個性十足的七騎士眾人後，尼莫自身也開始產生了變化。但黑暗卻已悄悄地對和平的校園生活伸出了魔掌——。

自然之理的攻勢越發激烈，尼莫也在仍不知寄宿自己身體裡的力量的真實身分下，一同前往嚴峻的戰場。前線奮力戰鬥的人群中，有著肩挑著小小王國命運的王子吉爾丹的身影。看見尼莫展現的驚人力量，讓吉爾丹湧起了自己或許會失去立足之地的不安，並且被焦躁給吞噬。吞噬少年們的黑暗究竟會何去何從。

尼莫終於漸漸被認同為＜七騎士＞的一員。然而拯救吉爾丹卻也讓他付出極大的代價，耗盡魔力不支倒地。法里亞因而片刻不離地照顧他。吉爾丹為何會被拖進破壞之力引發＜侵占＞？尼莫到底是什麼人？＜七騎士＞成員們在度過和平的片刻時亦各自懷著疑惑。另一方面，法里亞偷偷飼養的貓咪逃出了房間，尼莫和法里亞為了不讓其他人發現，只好努力追捕貓咪——。

尼莫至今仍完全不了解寄宿在自己身上、從未說出自身名謂的這個英雄，究竟隱藏著什麼樣的真相。有天，學院中發生了風紀委員接二連三遭受吸血鬼攻擊的事件。尼莫雖然主動表明想要幫助怒火中燒的雪莉，但雪莉並不領情，仍只想靠一己之力解決事件。然而引發事件的吸血鬼早已盯上了雪莉——。

加雷斯抽絲剝繭地解析至今的事件，想僅靠一己之力找出事件背後蠢蠢欲動的陰謀。而圖書委員的克蕾兒雖然一心想幫上他的忙，加雷斯卻不怎麼領情。另一方面，格蘭希學院即將迎來學院祭，到處都充滿著活動前的喧鬧。＜七騎士＞一行人不亦樂乎地聊著戀愛的話題，眾人最在意的就是學院季尾聲時舉辦的雙人舞，大家對彼此會找誰當舞伴都很感興趣，尼莫當然也不例外。當雪莉指名要尼莫當她的舞伴時，讓討論變得更加熱烈──。

克蕾兒因＜舊圖書館＞的詛咒而喪命。但與自然之理的戰爭迫在眉睫，眾人無法僅為緬懷一條生命而放慢角度。理事會命令學生會出擊前往＜布爾戈火山＞阻止自然之理即將引發的大規模魔術災害。只能聽從大人們的命令率領學生們趕赴戰場，令法里亞感到相當苦惱。有三個戰士在自然之理的基地迎擊法里亞等人，但他們竟也與格蘭希學院的學生一樣，是能夠與英雄簽約使用英雄之力的＜繼承者＞──！

被破壞之力侵蝕而失去理智的格蘭希戰士們。阿米斯．傑羅曼為達成破壞物質世界秩序的野心四處破壞銀沙漏，此時此刻，他的企圖看似就要達成了。然而包含尼莫在內的＜七騎士＞以通力合作對抗無法真正使用英雄之力、也不懂得如何合作的＜人造繼承者＞芮達、盧克斯和卡斯特爾三人──。

＜七騎士＞迎來與阿米斯．傑羅曼的最終決戰。面對像英雄借力戰鬥的少年少女，傑羅曼發出豪語聲稱自己才是這個時代的英雄，並展現他壓倒性的實力。芮達發現自己只不過是棄子，憤而向亞依林借力挑戰傑羅曼。另一方面，加雷斯從索菲蒂亞口中得知＜舊圖書館＞的秘密，一步步逼近克蕾兒死亡的真相──。

尼莫由於身為能使用＜舊圖書館詛咒＞之力的＜破壞之子＞而遭到眾人囚禁。法里亞等人雖因此倍感動搖，卻無法撼動加雷斯找到的不爭事實。尼莫開口訴說自己為了活下來，在吉尼爾斯的引導下逃出＜自然之理＞的掌控，裝成人類的樣子擺出笑臉只為求生存的過去。法里亞與尤諾米亞交談，試圖找出＜舊圖書館詛咒＞的真相，而在舊圖書館中找到＜時之書＞，為了尋求被掩埋的過去，決定前往與尼莫相遇的地點＜烏里村＞──。

在法里亞和芮達的幫助下，尼莫逃出格蘭希學院，重新體認自己到底該做什麼、追求什麼。他找到的答案是要保護自己珍惜的事物。身體已遭＜舊圖書館的詛咒＞侵蝕的法里亞發誓賭上自己的生命與尼莫並肩作戰。另一方面，格蘭希學院因詛咒的力量解放即將殃及全世界，尼莫等人為了阻止災厄，乘著飛艇再度回到學院，這時，阻擋眼前的，竟是他們最為珍惜的朋友們──。

索菲蒂亞終於表現出她的瘋狂野心，她口中的救贖其實是賜予所有生命平等的死亡。她成為破壞神降世的化身發動了攻勢，使得格蘭希學院陷入了火海。為了幫助意圖阻止索菲蒂亞的尼莫和法里亞，七騎士們一個個憑著自己的決心挺身對抗，一同面對最後的大戰──！一切都是為了達成該做的事，為了實現自己的心願。