赫連曦正想帶走涼蟾，昔舊此時趕到，聽到昔舊對涼蟾世子妃的稱呼，讓赫連曦心中充滿困惑。赫連曦讓自己下屬琴桑前去調查有關鳳鳶的身份。幽暗的地牢中，曾設計綁架涼蟾的暗衛向自己的首領報告見到了赫連曦一事。涼蟾受驚陷入昏迷，赫連曦偷潜入世子府，並確認了集市上販賣的樹的畫確是涼蟾所畫。

經過這幾日的遭遇，涼蟾向昔舊提議推遲婚期，她覺得自己和這個神秘男人的關係會給朔雲帶來麻煩，昔舊卻無所畏懼，表示自己一定會守護好涼蟾。婚禮這日，一群暗衛發動了襲擊，赫連曦現身同昔舊一起對抗暗衛，帶走了涼蟾。爲了讓涼蟾想起過往，赫連曦用樹心將她帶到了神樹的神識之境，觸碰到神樹的一刹那，回憶閃現，涼蟾也因此開始相信眼前的這個男人所說的話，或許他們曾經真的是夫妻，而他尋找的連理枝也只有自己知道在何處。

涼蟾向昔舊表明赫連曦的身份，昔舊卻說霖川族早已消亡，霖川少主的身份不可信。涼蟾告知昔舊自己可能曾是赫連曦的妻子，必須同昔舊退婚。昔舊態度决絕，表示在涼蟾恢復記憶之前自己絕不退婚。此時下屬來報，朔雲大君回來了，讓昔舊即刻前去相見。赫連曦帶涼蟾回到南枝苑，琴桑早已認出涼蟾便是曾對自己有救命之恩的霖川少夫人鳳鳶，也知道她如今失憶，友好地同她分享曾經她們在霖川吃的水果石榴。

赫連曦因鳳鳶想知道除連理枝外兩人所有的過去而爭吵起來。赫連曦爲了讓鳳鳶恢復記憶，另想他法，向朔雲大君求可通過去占未來的天乩術，大君爲報當年霖川族救命之恩爽快答應，可赫連曦揣測出大君一旦使用此術後會遭反噬，還是放棄。鳳鳶得知昔舊因執意不肯退婚被大君關入大牢受刑，找大君悔婚，並按朔雲族規承受三天三夜日曬雨淋的刑罰。

昔舊鳳鳶完成了剩下一天一夜的刑罰。赫連曦悄悄照顧虛弱的鳳鳶，意外發現她手臂上有一塊傷疤，而這傷疤處原本是一個樹葉的印記。赫連曦困惑鳳鳶身上到底發生了什麽，以及爲何在朔雲會有人刺殺她。因著愈發多的疑點，赫連曦决意前往永照國，取回一樣可能會幫助鳳鳶恢復記憶的東西。

三年前，鳳鳶傷勢恢復卻忘記了自己是誰，昔舊看著天上明月給她取名涼蟾。鳳鳶請辭之際，昔舊因內傷倒下，鳳鳶果敢相救。昔舊想起過往再看今朝，唏噓不已。此時，雲暮自投羅網，故意告知昔舊，鳳鳶是永照國公主。鳳鳶根據已知線索揣測出自己可能是一位公主。赫連曦從永照國帶回可治百病的神樹樹魄，昔舊卻趕來奪走，並要留下保護鳳鳶。

鳳鳶給被火燒傷的赫連曦上藥，卻偶然撞見他悄悄用樹心變幻出的夜螢點亮行人手中的燈，與自己受刑時看到的“星光”一樣。傷口處理好，鳳鳶將從昔舊處要回的樹魄交還赫連曦。昔舊得知城中不少百姓失踪，只能暫時離開南枝苑。赫連曦懼火，鳳鳶用螢石做燈，點亮他的黑夜，直言這段時日對赫連曦新的認知，要求喝下樹魄熬的湯來恢復記憶。

赫連曦得知鳳鳶心口有傷，趕往世子府確認當年鳳鳶的傷勢情况。赫連曦懷疑鳳鳶心口的傷是連理枝所致，她當年用連理枝自戕以命易命，他才能活下來，但他不明白若真如此，鳳鳶爲何能活著？昔舊查出失踪的百姓均爲有霖川血統之人，並得到一個劫匪的戒指，戒指圖騰與赫連曦衣著上的一致，他不由懷疑赫連曦的目的。

三年前，鳳鳶在鳳垠的脅迫下帶著刺殺赫連曦的任務遠嫁霖川。成婚當日，赫連曦卻叫停了霖川少主成婚獨有的連理入骨式。原來將沾取兩人血液的連理枝入骨之後，夫婦二人便有了一次以命易命換另一人生機的機會。赫連曦早對鳳鳶一見鍾情，不僅不想將性命攸關之事強加於她，婚後更是尊重她，照顧她。成婚第二日，赫連曦帶鳳鳶去神樹下進行結印式，結印成功便可得神樹庇佑，但鳳鳶身爲外族人，無法結印成功。

赫連曦怕鳳鳶身在異鄉孤寂，便送她畫具打發時間，但他總覺著她心事重重。鳳鳶確實寢食難安，花娥以她母妃手指甲逼迫她三日內下手，她飽受煎熬，卻別無他法，只能硬著頭皮讓赫連曦留宿。一場刺殺赫連曦，雙手沾滿血腥的噩夢後，鳳鳶幡然醒悟，她不能傷害無辜的赫連曦。

赫連曦出發前帶鳳鳶領略霖川的風情民俗，並帶她到神樹下，借著有安睡之效的夜螢讓長久難以入眠鳳鳶得以一夜安睡。鳳鳶第二天醒來，赫連曦已經留信離開，託付她照看象徵愛情的石榴樹，石榴花開之際他便歸來。花娥得知赫連曦離開，尋機毀滅神樹，原來她到霖川的真正目的是促成赫連曦死，神樹枯，有強大力量的神樹樹心才會出現。

鳳鳶因救神樹受傷，霖川百姓紛紛上門表達最純粹的感謝，鳳鳶感動不已。花娥也趁亂逃離了霖川，鳳鳶等待烏韭平定叛亂之際，撿到身著永照騎兵鎧甲的姑娘琴桑。鳳鳶用赫連曦留下的神樹樹魄救活命懸一綫的琴桑。鳳鳶從醒來的琴桑口中推測，烏韭可能已經平定了叛亂，此時烏韭的信件送達，證實了她的猜測，鳳鳶歡喜，她所憂心的一切都已解决。

赫連曦和鳳鳶留下已無親人的琴桑。鳳鳶將寓含愛意的五月石榴花做成胭脂，在林間與琴桑、銀翹嬉笑歡鬧。赫連曦因著這一趟的外出，見識了永照的精兵強將，憂心霖川的安危。鳳鳶放下心結，徹底融入霖川生活，與族人篝火搶花環，也終於與赫連曦心意相通。此時，烏韭將軍也來到霖川探望鳳鳶，鳳鳶得知他父君心軟，只是將鳳垠囚禁。

赫連曦完成結葉式，虛弱不堪回來，給鳳鳶送上用神樹樹脂做的石榴簪。鳳鳶找椿婆婆瞞著赫連曦進行連理入骨，並在霖川度過了此生最快樂的時光。然好景不長，鳳鳶收到父君病危的信件，勸服赫連曦留下，在琴桑的陪同下回永照，赫連曦將當初鳳鳶刺殺不成埋起的匕首交還，讓她防身，兩人約定石榴花開時便歸來。

永照現任君王鳳慶內疚，偷偷見姑姑鳳鳶，此時鳳鳶已身懷六甲，卻被告知赫連曦來到了永照。鳳鳶被刺激，腹痛早産。大殿之上，赫連曦不見鳳鳶，心中焦急，鳳垠手下雲暮借烏韭將軍部下之名給赫連曦毒酒，鳳鳶痛苦生産中，赫連曦毒發被擒。鳳鳶生下孩子，爲保孩子安全，忍痛用夜螢粉讓剛出生的孩子假死，將她託付給鳳慶。

鳳鳶向昔舊確認三年前自己的心口並無連理枝，而連理枝是赫連曦復甦神樹，解封族人的希望。鳳鳶帶著愧疚在神樹靈識之境找到了當年遺失的另一隻耳環，面對回不去的霖川，她不敢承認自己恢復了記憶。昔舊向赫連曦道謝，謝他捨命救族人之恩，兩人自此化解誤會。赫連曦更願以樹心相救垂危的朔雲族人，他原以爲樹心有復生之效，但卻徒勞。

赫連曦從天乩雲盤中見到當年鳳鳶爲救自己被鳳垠追殺，墜崖前用連理枝自戕換他活下來。鳳鳶將積鬱在心頭的過往與昔舊坦白。赫連曦匆匆趕回，他拉開鳳鳶的手臂，終於明白那傷疤的由來，鳳鳶因再沒連理枝而愧疚痛哭。昔舊回到府中，得知大君因使用天乩術付出的代價是雙眼失明。赫連曦寬慰鳳鳶除了連理枝外，也許兩顆樹心也能復甦神樹，兩人確認了神秘人爲鳳垠，另一顆樹心在他手中，遂向昔舊請辭離開朔雲，前往永照奪取樹心。

兩人的女兒石榴在鳳鳶表妹石罌的照顧下長大，她喚石罌娘親，赫連曦爲叔叔。鳳鳶面對女兒，不敢言明自己的身份，只告訴她自己是她的姨母。石罌挽留鳳鳶留在醫館住下，可她看著兩人彼此深愛互相依偎的模樣，心中又苦澀又欣慰。赫連曦夜探永照王宮，發現鳳垠還未回來，當今永照王鳳慶年紀雖小卻已具君王之威，暗中調查窺探永照的神秘組織。

赫連曦在天乩雲盤中看到一個戴琵琶簪的女人放火燒神樹，雖然大君未言明這就是結局，但若神樹被燒毀，再無復甦的希望。赫連曦在街頭尋找琵琶簪時，遇上剛到永照的昔舊。昔舊因一樁誤會與石罌不打不相識。赫連曦發現鳳鳶不見了，原來鳳鳶的計劃是利用自己孤身回宮的消息，引鳳垠現身。鳳鳶恍如隔世般回到宮中，雲暮被抓，鳳鳶認出他就是當初淩遲赫連曦之人。