科學小飛俠 II

面對武神像迎面襲來的攻擊，一個神秘的身影適時替小飛俠們解危。歐俊也被白羽手裡劍打倒。鐵雄等人再次回想起有關大明的記憶。

一卷警示惡魔黨基地建設計劃的錄音帶，被送到了國際科學技術廳。科學小飛俠根據錄音帶內，酷似大明聲音所提供的線索，前往弗蘭茲魯斯。

惡魔黨在戴拉沙漠地底建設的秘密基地意外發生大爆炸。鄰近的城市受到影響，發生了大地震。

大約三萬五千年前滅絕的原始人在現代復活，他們摧毀了叢林地區富爾吉尼亞的村莊。科學小飛俠前往村莊調查，發現之前認識的移民家庭藤堂一家中，只有年幼的兒子倖存。

地中海洛德島南方海面，接連發生飛機與船隻失蹤的事故。這片海域中散佈許多無人島，而其中心正是由伊吉普特財團，以金字塔能量系統實用化為目標，所建設的金字塔都市。

無名主宰開發了能快速成長並且攻擊人類的宇宙植物「蕾達」。然而，在最終實驗過程中，由於隊員的失誤導致一顆種子遺失。

為了調查觀測衛星連續消失的真相，珍珍與阿丁搭乘天文觀測衛星前往現場。然而，觀測衛星卻被突如其來的黑色巨大移動要塞擄走了。

科學小飛俠在北極海發現了惡魔黨的基地，駕駛新鳳凰號出動。察覺此事的杜蘭莎朝科學小飛俠的航道發射飛彈，並且自信地以為勝券在握。無名主宰看著杜蘭莎，想起過去的部下皮爾。於是他提出忠告，要杜蘭莎不可大意。

南國的島嶼突然遭受猛烈暴風雪襲擊，數萬人凍死。在近海偵察的阿龍，座機受潮流影響而故障，被沖到某座島上。阿龍在島上遇到了專門捕鯊魚的老人羅科。

鐵雄與阿丁在去觀賞潛水艇下水儀式的途中，坐上了一名叫茱莉亞的女性的車。然而，三人抵達港口時，卻捲入了惡魔黨機械烏鴉的無差別攻擊，茱莉亞因此受傷。

各國的天文台與氣象觀測設施遭到不明飛行物體攻擊。在宇宙通訊學領域的科學家接連遭到暗殺之際，重量級學者卡辛古博士也因科學小飛俠來遲，不幸身亡。

單獨潛入惡魔黨基地的大明，遇到了神秘女子凱西。她自稱是「大明的影子」，並告訴大明，敵人主力部隊已經轉移到位於火山地帶的維蘇威市。

疑似外星人的太空船飛抵地球，並與國際科學技術廳取得聯繫。然而，從降落的太空船中現身的卻是一個月前，在與惡魔黨的戰鬥中身亡的博爾格少校。

不明飛行物體墜落在某個南國的山區。前去調查的阿龍在墜落現場附近發現房屋被燒毀，空無一人的荒涼村莊。此時，阿龍遇見了一位名叫優香的少女，並對她一見鍾情。

惡魔黨的逃兵將極機密檔案帶進國際科學技術廳。為了破譯密碼，大明被指派將檔案運送至昂格雷研究所。惡魔黨發現此事後，對大明的車子發動襲擊。

海洋實驗都市席特蘭遭到惡魔黨的巨大機械獸攻擊。幸運的是，都市最高負責人席斯基博士因為外出逃過一劫。他的女兒蜜莉是珍珍的兒時玩伴，卻並未出現在倖存者之中。

停放在火箭基地機庫的太空聯絡艇發生故障，珍珍與阿丁前往修理。然而，在珍珍一個不留神的瞬間，一名少女將槍指向阿丁，使他不得不放開安全裝置的按鈕。

阿龍懷疑大明獨自偷騎機車外出，於是悄悄跟蹤他。卻在追到奧西亞地區的荒野時失去了大明的蹤影。就在此時，突然出現的神秘光芒向阿龍逼近，將他吞噬了。

度假勝地十疊島瞬間沉入海中。為了查明原因，珍珍在附近島嶼搜尋時發現了一名受傷的女性。然而，這是惡魔黨設下的陷阱，珍珍因此被俘。