遊作把黑客集團漢諾騎士追尋的神秘生命體弄到手後，為了打倒漢諾騎士，以Playmaker的身份登錄了VR空間LINK VRAINS。他以神秘生命體為人質向對方提出決鬥。

遊作對隱藏於神秘生命體身上的情報開始了調查。另一方面，與漢諾騎士的決鬥被人從網絡上目擊後，Playmaker作為拯救了LINK VRAINS的英雄，成為了一大話題。

漢諾騎士突然出現在了VR空間LINK VRAINS當中。然而其真正身份是，盯上了Playmaker的決鬥領袖Go鬼塚。

Go鬼塚就像職業摔角選手一樣大膽地上演驚險危機，把決鬥作為一種娛樂來展現出其魅力。儘管知道這和自己冷靜的操作風格很不同，但Playmaker卻意識到自己對Go鬼塚的決鬥開始產生興趣了。

財前葵作為決鬥領袖Blue Angel，在LINK VRAINS當中無比活躍。她為了得到自己哥哥財前晃的認同，便在LINK VRAINS眾人面前向Playmaker提出了決鬥。可是，她並沒有收到Playmaker的答復，出現在她面前的是冒充粉絲的漢諾騎士成員之一的Spectre！

遊作從Blue Angel背後感覺到了漢諾騎士的氣息，為查明真意而接受了決鬥。Blue Angel自如運用效果傷害的戰術，慢慢逼得Playmaker走投無路。想被哥哥財前晃認同的這份強烈決心，把Blue Angel的決鬥推向了無法回頭的境地……。

財前葵因為漢諾騎士設下的程式影響而陷入昏睡狀態。遊作覺得自己需要為此負責，便開始和草薙等人調查原因。但就在那時，城市的螢幕上卻出現了Blue Angel，並且她向Playmaker再次提出了對決。

Playmaker和左輪圍繞能除去侵蝕葵的病毒的程式，和被人稱為伊格尼斯的Ai，而展開決鬥。面對左輪召喚出的破解龍，Playmaker使用至今為止的決鬥所得的連接怪獸將其迅速擊破。正以為這樣一進一退的決鬥將會繼續下去的時候，左輪發動了衝擊性的技能！

左輪發動了強力技能，Playmaker在對方獲得壓倒性力量的猛攻面前，只能被迫防守。就在以為靠Storm access起死回生拿到逆轉卡的時候，兩人的決鬥由於左輪所採取的作戰計畫，而將舞台轉移到了Data Storm的內部。

Playmaker因為左輪說出的真相而不知所措，並且遭受到左輪的王牌怪獸裝彈槍管龍的強烈一擊後倒了下來。正當Playmaker逐漸失去意識之際，他因腦海中傳來的神秘聲音而甦醒過來，並重新站了起來。他的眼神之中有著不可動搖的鬥志。

Playmaker操縱的防火牆龍竭盡最後的力量，與左輪的裝彈槍管龍奮力對抗。Playmaker誓要報過去某次事件的仇，而左輪則企圖消滅伊格尼斯。兩股意志與對峙的兩頭龍，此刻即將展開激烈碰撞！

遊作結束與左輪之間的激鬥後，和草薙一起分析關於伊格尼斯的情報。另一方面在LINK VRAINS那邊，目擊到Playmaker的神秘決鬥者Ghost Girl接受了採訪。她講出了至今為止發生的漢諾騎士襲擊事件以及Playmaker戰鬥的事。

對十年前的事件產生興趣的Ghost Girl，要求Playmaker和她進行賭上Ai的決鬥。遊作得知只要勝利就能得到入侵SOL技術公司資料庫的程式，便前往了LINK VRAINS。為了揭露十年前事件的真相，明知有危險但依舊接受挑戰的遊作，遭到了神出鬼沒的Ghost Girl所操縱的幻變騷靈卡組的襲擊。

Ghost Girl運用變幻無常的戰術，展開令人預料不到走向的決鬥。另一邊的Playmaker也是一邊冷靜分析Ghost Girl的舉動，一邊等待施展Storm access的機會到來。兩人展開了互相解讀對方背後意圖的敏銳心理戰，最後獲得勝利的究竟會是哪一邊呢？

Playmaker為了調查10年前的事件而入侵了SOL技術公司的主電腦，並前往位於系統深層的資料庫。但是決鬥AI程式卻攔住了Playmaker的去路。面對新的威脅，Playmaker能否成功抓住真相呢。

Blue Angel趕到了正在遭受AI程式們妨礙的Playmaker的身邊。Playmaker在她的活躍表現下擺脫了困境，向主電腦的深層趕去。然而，在到達目標資料庫之後，卻出現了一個人攔住了Playmaker的去路···。

Playmaker入侵了SOL技術公司的資料庫，然而等待他的人卻是財前晃。晃想制止燃起復仇心的Playmaker，但Playmaker根本聽不進他所說的話。隨後Playmaker要求晃用決鬥來做個了斷。背對著藏有事件真相的資料庫，兩人之間的戰鬥打響了。

財前晃操縱廷達魔三角卡組，施展出了巧妙的戰術。Playmaker也同樣用電子界卡組進行對抗。在資料庫內展開激烈攻防的同時，晃開始講述起了10年前發生的事件。緊接著，遊作壯烈的過去也終於真相大白…！！

財前晃用盡所有手段，想要把Playmaker逼到走投無路。然而Playmaker仍竭盡全力使出最後的力量，想靠連續進行連接召喚來完成一招逆轉。晃的王牌怪獸廷達魔三角·銳角地獄犬和Playmaker的防火牆龍展開激烈碰撞！