在兄弟姊妹之間的合作下，太陽與六美克服了凶一郎大哥的干擾，正式成為夫妻，隔天早上，在自己房間睡醒的太陽，突然被凶一郎用鋼絲懸掛起來，同時家裡也突然發生爆炸，太陽驚訝地發現有人在自己家中設置了炸彈。太陽從凶一郎口中得知了夜櫻家的使命，理解了「守護六美」的真正含義，然後太陽作為夜櫻家的一員，初次被賦予了「今天要從暗殺者的手中守護六美」的任務！

太陽做了一個"因為自己的力量不足導致六美被擄走的夢"，因此她希望自己能夠變得更強，他向二刃姊姊提出對自己進行特訓的要求，二刃姊姊表示若要進行特訓，第一個條件就是要太陽在夜櫻家生活一個月，在夜櫻家的房子裡，有各式各樣的陷阱正等待著太陽，對太陽來說，在夜櫻家生活成為了他地獄般的日常，另一方面，六美看著為了自己每天刻苦耐勞訓練的太陽，心裡也感到痛苦不已…

正在處理工作事務的六美，發現嫌五提交的報告書存在瑕疵。雖然要求重新提交，但嫌五卻試圖找藉口逃避責任，這讓六美忍無可忍！作為夜櫻家的當家，她決定對嫌五採取行動，但嫌五卻輕易逃走。為了抓住他，六美啟動了「冬眠」計劃，封鎖了宅邸，並開始在兄妹的房間中進行搜索。使用特務技巧的追逐遊戲開始了...！

太陽被自稱為佛山的警察男子帶走，而太陽在任務中擊敗敵人的畫面，不知為何被公開在暗網上，佛山不相信單憑一個少年的力量能夠做出這樣的犯行，於是懷疑太陽背地裡涉及秘密組織，但是卻得不到任何共犯的情報，太陽努力忍受著名為"審訊"的無理拷問，佛山甚至還暗示了六美的存在來進行威脅，但太陽卻因此注意到了某件事情...！？

夜櫻家的資料庫被駭客入侵了!? 從四恐的報告中得知，只有太陽的個人資料被盜竊，太陽因此感到一絲不安。某個早晨，當太陽和六美在上學途中，突然出現了一個名叫切崎殺香的間諜，她是會跟蹤迷戀上的男性並將其殺死的"男性獵人"。她聲稱在暗網上看到了太陽的影片後一見鍾情。切崎殺香轉入太陽和六美的班級，甚至在課堂上也企圖暗殺太陽，但卻屢次失敗。接下來她採取了最終手段……！

在潛入某邪惡研究所的過程中，七惡自願注入了含有劇毒的化學武器。而七惡也由於體內的解毒副作用而陷入睡眠。太陽為了回收七惡，前往邪惡研究所，太陽遇到了直屬政府的諜報組織「雛菊」的蒼翠與犬神王。雖然他們一起進行研究所的搜查工作，卻發現「雛菊」的兩人視七惡為危險物品，打算殺死七惡！太陽挺身而出保護七惡，卻慘敗在翠的手下。雖然七惡解毒完成，證明自己沒有危險性，但太陽深深反省自己玷汙了夜櫻家的名聲，為了...

太陽和六美在翠的帶領下，來到「雛菊」的地下基地。室長不動凜出面迎接兩人，原來是六美本來就會定期與雛菊舉辦茶會，就在這時，凶一郎闖入雛菊基地，為了與凜搶奪六美而開打！兩人的攻防戰愈演愈烈，在館內開始發佈緊急避難廣播時，太陽挺身而出阻止兩人。本來擔心太陽太過軟弱的凜因此改觀，委託太陽潛入調查現今最受矚目的政治家——黑百合黨。

黑百合炸毀護送車，也讓黑百合趁機逃脫。太陽向翠報告狀況後，才得知黑百合的真實身份是早在5、6年前就應該已經死去的傳奇特務——黑顏。太陽等人打算追捕逃跑的黑顏，但不知為何，黑顏帶著被他綁架的副總理，正大光明地在網路直播中現身在大眾面前。爲了報仇，黑顏把槍口對準副總理，在這裡訴說著過去的恩怨以及目的。及時趕來的太陽中斷網路直播，與黑顏展開對峙！

太陽和六美受到邀請，前往「雛菊」基地參加任務完成的慶功宴。可是，硬是陪同六美一起前來的凶一郎和他的冤家凜展開激烈戰鬥，導致基地內變成了戰場…慶功宴接近尾聲時，看準時機悄悄離開的太陽，凝視著他按照黑顏的遺言，在樹洞中找到的小盒子。據說裡面藏有太陽去世家人的情報。但太陽對開啟盒子後的真相感到不安，遲遲無法將其打開…

新寫好的程式出現bug。二刃看到因為bug而出現在螢幕上的妖怪後被嚇到昏倒了，這位最可靠的長女，弱點竟然是「妖怪」和「詛咒」！風聲和天花板嘎吱嘎吱的聲音，連四怨的開玩笑都讓二刃顫抖不已，據說過了一天就能恢復成往常的二刃，今天整天纏著六美一刻也不肯離開。更何況最近夜櫻宅邸中傳聞「明明沒有人卻有聲響」!?太陽和弟妹們必須照顧膽怯的二刃……！

放學以後，太陽打開包包，竟有一個神祕人物從包包裡面爬出來！這位可疑人物的真實身份其實是六美的外祖父夜"櫻萬"。為了祝賀外孫女與孫女婿的婚事，而從監獄裡逃了出來，櫻萬輕輕鬆鬆地躲過了凶一郎的鋼蜘蛛，強行將太陽帶到了夜總會。在凶一郎的指示下，太陽嘗試各種手法試圖捕捉萬，但總被萬愚弄，全部以失敗告終……。

根據四怨的分析，從黑顏手中拿到的光學保存體中，有夜櫻家第9代當家夫婦的婚宴來賓名單。但是來賓當中竟有太陽死去的父親朝野日出與母親朝野光的名字！太陽等人知道了自己與夜櫻家兄弟姊妹們出生以前，夜櫻家和朝野家就有關聯。而太陽決定造訪「故人圖書館」尋找家人的真正死因。然而那裡卻是「出聲就會死亡」的可怕地方！在四怨的幫助下，太陽能找到有關家人的資料嗎！？

從皮下醫生的電腦中竊取到的資料，無論怎麼分析，都找不出蒲公英的據點。但是找到的收據當中，有一間名字音近蒲公英英文名字「dandelion」的「紳士獅子飯店」引起了太陽的注意，認為值得一查。但隔天早晨，太陽一醒來，人卻在太平洋近海的船上？！在完全搞不清楚狀況的太陽面前，可以看到正在釣魚的凶一郎。凶一郎對太陽說出平常不會說的台詞，並且面帶微笑親切對待他，讓太陽提高了警覺心。這時太陽釣到了魚，一拉...

太陽為了調查與家族之死有關、並企圖謀害六美性命的神秘組織「蒲公英」，作為重要線索，太陽追蹤皮下真潛入高級飯店「紳士獅子」。然而，他遭到了施打了興奮劑「葉櫻」的飯店總經理能面的阻撓。太陽陷入危急時刻，而辛三趕來救援。雖然辛三成功幫助太陽逃脫並與能面交鋒，但能面卻把飯店裡的普通人們都當作人質，因而陷入了困境。在這個只能選擇投降的劣勢局面下，辛三做出的選擇是……！？

夜櫻家的當家才擁有啟動權限的「冬眠」竟然突然啟動了！？凶一郎對啟動「冬眠」的人心裡有數，找到持有第9代當家「櫻之戒」的男子。另一方面，六美正在照顧遲遲無法回復意識的太陽，屋內突然停電，與兄弟姊妹間的通訊被截斷。七惡房間內的醫療設備也停擺，太陽的脈搏迅速減弱下來。如果繼續這樣下去，太陽將會死去……！為了維繫重要之人的性命，六美不得不做出一個決定！

太陽突然接到七惡的電話，請太陽趕緊前往生物室。在那裡，因身體異常膨脹的七惡倒在地上。雖然暫時經由太陽的緊急注射讓症狀得以緩解，但一般的藥物已經無法再有效治療。為了防止變異，唯一的方法是接種「穩定化疫苗」。但一旦接種，七惡將再也無法恢復成普通少年的身形，也必須退學。太陽決心讓七惡不用接種疫苗，要保護他的普通學校生活！

而六美參加勇妄夢樂城的抽獎，抽到了「無限地獄溫泉」住宿券。唯有凶一郎有任務抽不開身，只能心不甘情不願地留下。「無限地獄溫泉」是完全招待制的地下社會專用度假勝地，光靠普通手段無法抵達。翻山越嶺、潛入湖泊，終於抵達了旅館！在老闆娘的引導下，太陽一行人在度假勝地放送身心，療癒日常的疲憊，但事情似乎並不那麼簡單...!?

爲了尋找百的行蹤，太陽等人循線追查著"蒲公英"的行蹤。終於找到了數個蒲公英的關聯設施與疑似運載葉櫻的走私路線。太陽潛入了其中一輛觀光火車，以服務員的身分忙碌的工作著，同時留意著有無可疑人物。然後不僅沒有發現百的蹤跡，連蒲公英的線索都找不到……！在太陽快要放棄，認為這是假的情報時，卻從乘客對於各項異狀的投訴中，讓太陽察覺到了異樣！？

太陽使用新武器「八重之貳」來對抗不會導電的白蛇之髮。兩人在觀光列車中展開了激烈的攻防。就在這期間，為了不被外面觀察戰鬥的皮下察覺，白蛇將自己的頭髮當作文字，向太陽傳遞信息。她傳遞的內容與太陽父母的死有關。白蛇揭示了太陽父母生前所隱藏的、被掩蓋的殘酷且驚人的真相——。